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沈玥:我們正在顛覆進化論,再造伊甸園



沈玥:我們正在顛覆進化論,再造伊甸園


華大基因x造就 聯合呈現


沈玥


華大基因 深圳國家基因庫合成與編輯平台負責人

有三個問題困擾了人類幾千年——我是誰,我從哪來,我要去哪裡?


究竟我們的生命的本質是什麼,我們從怎麼樣的一個形式,演化而來,我們未來可能會變成什麼樣子?


從上帝決定論到基因決定論

沈玥:我們正在顛覆進化論,再造伊甸園


在文明初期,關於這個問題,西方主要是以上帝創世紀的故事呈現,而東方則是盤古開天闢地,女媧造人的傳說。


冥冥之中,大家都覺得有一個超越生命之上的存在,在掌控著生命,這好像已經成為一個共識,但是科學的發展使得我們摒棄了這樣陳舊的觀念。

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從孟德爾用三萬多株豌豆發現遺傳的規律,到後來格里菲斯和艾弗里證明了DNA才是遺傳物質的基礎,再到富蘭克林通過晶體衍射給DNA拍了照片,在這個基礎之上,沃森和克里克又通過解析DNA,發現它原來是雙螺旋結構……這樣一步一步,我們慢慢對生命的本質有了一個清晰的概念。

那麼下一步就是研究這些信息是怎麼樣構成生命的,這樣簡單的四個鹼基,A、T、C、G,它是以怎麼樣的一個形式,使得我們人成為人,動物成為動物?


在20世紀的最後十年,「人類基因組計劃」使這個問題有了決定性進展。

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參與「人類基因組計劃」的六個國家,用了13年的時間,花了30億美金,完成了第一個個人的基因組的測定和描繪,這之後,我們才大概知道了原來生命是這個樣子。


在這之後有成千上萬的基因組得到解析,我們慢慢地知道了我們頭髮的顏色,五官的樣子,我們的高矮胖瘦,為什麼會這麼不同。


除了人類之外,我們對其它的物種也有了遍地開花的研究,我們越來越了解到生命是怎麼樣演化過來的;我們也知道物種之間的相似處和差別是什麼。


所有的這些秘密都藏在基因和基因組裡面。


人類和老鼠有80%的基因相似卻樣子如此不同,因為基因一直在變化

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比如說我們和植物只有17%的相似性,我們和小白鼠卻有80%的相似性,我們和猴子、大猩猩的相似性已經超過90%,我們人和人之間這麼不同,但是在我們的基因組上,也只有0.5%的差異。


基因這個生命密碼,就像是一個啟動生命的程序,但它並不是一成不變的,相反,它一直在變化的。

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大家看到西蘭花、捲心菜、花菜,這幾種我們餐桌上非常常見的食物,它們長相不同,味道不同,但它們卻是甘藍這個2500年以前出現的植物,因為基因隨機突變,長期自然選擇之後演化出來的一些新的生物。


我們逐漸顛覆達爾文之後,有沒有可能開始扮演上帝?

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隨著技術的發展,我們已經進入可以人為加速生命密碼改變的階段。


比如說線粒體缺陷的問題。


線粒體是細胞裡面的一個細胞器,當這個很小的細胞器產生缺陷之後,會導致非常嚴重的結果,比如說先天性心臟病,失明或者是肝衰竭,並且線粒體缺陷是隨著母親向下遺傳的,這也就意味著如果一個母親是線粒體缺陷疾病的患者,那她的孩子無一例外一定都是患者。

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而人為的干預可以改變這個情況。


我們把患病母親的DNA通過核移植的方式,轉運到另外一個健康女性的卵子裡面,然後用這個卵子,來做受孕的載體,這樣一來就可以使得她的孩子不再成為線粒體缺陷類疾病的患者。


他的基因,即他的生命密碼,也由此發生了改變,這個改變逆轉了他一定會得病的命運。


所以,四十億年前,生命主要是依靠隨機突變和自然選擇的一個方式去生存的,而我們現在正在通過一種並行式的思路,把進化的過程加速,使它成為一種可以是非自然選擇、定向變異的過程。

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在某種程度上,我們已經在逐漸地顛覆達爾文的進化論。


緊接著下一個問題是,我們有沒有可能扮演上帝,創造生命?


這裡的人造生命不是指AI,不是指Alpha Go,而是指我們在DNA、RNA,以及一系列必需的物質基礎上,創造出來的一個活生生的生命。


這個問題在2010年的時候就已經有了一個非常肯定的答案。


第一個人造生命是以計算機為母體

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這是一個叫做支原體的基因組的一個序列,科學家通過計算機以及四種不同化學試劑的配合,可以從無到有地創造一個完整的基因組,然後把基因組轉移到一個受體的細胞裡面,這個生命的密碼得以啟動,使得這個細胞搖身一變,變成另外一個物種,我們把這個物種叫做「辛西婭」。


「辛西婭」是第一個以計算機為母體的一個生命,它的出現意味著什麼呢?意味著我們可以以計算機為起點,創造一個生命。


大多數的細菌都是原核生物,相比較而言是比較低等的生物,而生命的高級形式是真核生物,比如說我們人就是真核生物。


能否創造一個人造的真核生物,這是造物的一個新的高度。

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這個微生物叫做釀酒酵母,我們平時用它來做麵包、饅頭,用來釀酒。最近,我們的團隊做了一個酵母2.0版本,這個2.0版本就是世界上第一個真核的人造生物。


跟「辛西婭」和酵母1.0相比較,它的區別是什麼?


簡單來說,我們不僅是重現了一個真核生命,我們同時使得它變成了一種工具。

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舉個例子,大家都知道胡蘿蔔素,它主要是從胡蘿蔔裡面提取出來的,這個胡蘿蔔素在你攝取之後,可以轉化成維生素a,它能夠改善你的眼睛和皮膚的問題,那麼這個酵母2.0作為工具,只要簡單地通過外源基因的導入,就能生產胡蘿蔔素。


甚至我們可以控制它的產量。所以這意味著未來我們不需要有胡蘿蔔,就可以獲得大量的胡蘿蔔素。

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再舉另外一個例子,屠呦呦因為成功地從這種叫做黃蒿的植物中提取出青蒿素,獲得了去年的諾貝爾醫學或生理學獎。


青蒿素是目前用來治療瘧疾的唯一有效的藥物,但是在黃蒿裡面提取率非常低,只有1%~5%左右,而如剛才所說,通過酵母外源基因的導入,就可以使得我們的酵母變成青蒿素的一個細胞工廠,利用這樣的技術,一個簡單的一個生產線,青蒿素年產量即可超過全球需求量的三分之一,這是一個非常可觀的數字。


未來5年,合成生物成本降到目前的1%?

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在回顧我們創造2.0版本的酵母人造生命的歷程裡面,我們發現它在基因組的解讀上,也是有同樣的趨勢,就是從小到大,從簡單到複雜。


而能夠使得我們有這樣的發展是因為技術的更新換代。

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從我們測第一個基因組需要13年到今天我們只要一天的時間就能完成一個個體基因組的測序;同樣,過去合成技術一開始一天只能有百級的產量,到現在每天有萬級的通量,使得成本上有了一個非常大的變化。


我們把測序與合成的成本做了一個對比,取了一個log值,你可以看到在2003年,兩者的成本還差不多是一致的,但是後來,尤其是過去的五年裡面,測序成本急劇降低使得兩者之間的成本有了百萬級的差距。

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在過去的幾年裡面,我們的團隊一直專註於如何提升技術從而降低成本,現在我們可以非常自信地說,在未來的5~10年,我們可以把這個成本降到現在的百分之一。


那麼這個技術的突破會帶來什麼呢?


有可能在不久的將來,它能使得我們這個世界再次進入「寒武紀」時代,有大量的新物種,可以通過數字化的設計而產生。


合成生物學將解決90億人口在地球生存的問題

沈玥:我們正在顛覆進化論,再造伊甸園



大家可能會問,為什麼我們要做這樣的事情?


我們現在整個世界的人口是60億,但是在不到40年的時間,這個60億馬上會變成90億。


我們現在所有的食物、清潔能源以及我們的醫藥,都是圍繞這60億來準備,滿足60億人口就已經非常困難,更不用提90億人口會是怎麼樣的一個挑戰。


而合成生物學的知識和技術有可能改變這種現狀。


「人造生命」、「新物種」這樣的概念,已經不再是離我們很遠的事情,好像科幻片裡面才有的,它現在就在發生,這一刻就在發生。

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在不久的將來,我們也許可以通過生物合成新物種的方式讓更高效、更清潔的能源,全面取代傳統能源;


青蒿素的產量不再由種植面積和天氣來決定,可以完全在實驗室通過生物發酵的形式,通過合成生物學的方式,大量地產生,惠及大眾;


甚至說有器官移植需求的患者,他也不需要再經過漫長的等待,而是通過生物合成,讓人工器官立等可取;


甚至未來我們的海量的數據,都不需要通過硬碟的方式來存儲,一管DNA就可以代表整個文明史。


當那一天到來的時候,合成生物學就已經完全的改變了我們的世界。


謝謝!


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