韓春雨找出實驗難重複的原因?何必糾結NgAgo,CRISPR月內獲3大突破
作者:解螺旋.葉子
導語
11月23日,Nature發表了「NgAgo基因編輯爭議在同行評議論文中升級」的報道,是NgAgo再次處於爭議的中心。然而在這個月里,另一個大火的基因編輯工具CRISPR相關科研成果確是不斷刷屏,
11月23日晚間,Nature發表了「NgAgo基因編輯爭議在同行評議論文中升級」的報道。其中,韓春雨說他已經發現了一個問題,這個問題可能被他人忽視但可以用來解釋為什麼難以重複他的實驗。他正在進行確認工作,以保證發表的實驗操作和數據能讓批評者滿意。
與這飽受爭議的「NgAgo」相比,CRISPR技術則是成績斐然,屢獲進展,在這個月就被CRISPR的多項技術突破所刷屏,中國的川大華西的成果更是令中國學術界所振奮,「遠超美國了。」
CRISPR結合PD-1首次應用於人體
四川大學華西醫院全球首個CRISPR技術的人體應用在7月通過了倫理審批,10月正式啟動。這項試驗招募對象是非小細胞肺癌,且癌症已經擴散的患者,經化療、放療以及其他治療均無效。
科研人員從患者體內分離出T細胞,用CRISPR進行基因編輯,敲除了抑制PD-1的基因,進行體外擴增。細胞到一定數量後,再輸回患者體內。本次試驗計劃治療10名患者,他們每人將接受2-4次注射。
Steve Gschmeissner/Science Photo Library
由於腫瘤細胞是通過上調PD-L1表達並與腫瘤特異性的CD8+T細胞表面PD-1結合,限制了宿主的免疫反應。簡單的說,就是有PD-1的免疫細胞是殺不過腫瘤細胞的。而目前的PD-1抗體,Opdivo和Keytruda是通過阻斷PD-1來治療晚期非小細胞肺癌,效應率為15%-25%,而對於晚期鱗狀肺癌,效應率為33%。但是,PD-1抗體對很大一部分患者沒反應。
本次試驗的主要目的是檢驗這項療法的安全性。這些參與試驗的患者將得到長達半年的密切監護,以了解此項療法是否能對這些「無葯可治」的患者帶來益處,又是否會產生嚴重的副作用。如果這次臨床試驗被成功執行,中國將保持一系列CRISPR領域「No.1」的記錄:第一個CRISPR編輯的人類胚胎,以及第一個CRISPR編輯的猴子都在中國誕生,結果讓我們拭目以待吧。
參考文獻:CRISPR gene-editing tested in a person for the first time
成功用人工病毒進行CRISPR/Cas9輸送
這項成果出自同是四川大學華西醫院的魏於全課題組,首次採用人工病毒進行CRISPR/Cas9輸送,成功在小鼠腫瘤模型中完成了靶基因編輯,達到了較好的腫瘤治療效果。這個實驗的亮點在哪呢?以前的人體實驗都是在體外進行基因編輯,完事後再回輸體內。
這樣人們就會想到,能不能直接在體內進行編輯呢?目前體內給葯CRISPR質粒DNA的手段有三種,第一種是水流動力學注射,也就是打點滴,將大約是小鼠體重10%的DNA質粒注射液通過尾靜脈在3-8秒內注射到小鼠體內,但這種方法會造成血壓瞬間升高,產生器官損傷,在人體上用更是沒戲。第二種是局部注射,也就是打針,缺點么,對於人體深部輸送得要多長的針頭啊。第三種是用腺病毒載體進行輸送,但腺病毒有免疫原性,有可能會引起免疫反應,而且CRISPR質粒DNA很大,腺病毒負載不夠,效率不高。
既然這些方法都有缺陷,就要另闢蹊徑了,課題組合成了一種新的人工病毒來輸送CRISPR/Cas9質粒DNA。他們合成了靶向乳腺癌中的MTH1基因的CRISPR/Cas9質粒DNA(Cas9-hMTH1)在小鼠體內進行了實驗驗證。為了增強人工病毒的輸送效率,用了多功能高分子RGD-R8-PEG-HA對人工病毒進行修飾得到了終極產物,靶向MTH1的多功能核殼結構CRISPR/Cas9輸送人工病毒(RRPHC/Cas9-hMTH1)。
這種高分子可以使人工病毒更穩定,同時避免被免疫系統清除,RGD和HA可以同時靶向結合腫瘤部位高表達的整合素ανβ3和CD44受體,從而提高人工病毒在腫瘤部位的富集。經過體外細胞轉染實驗驗證該方法的轉染效率高於商用轉染試劑,功能性實驗也表明該人工病毒可以成功敲除MTH1,顯著抑制乳腺癌細胞增殖。最後經過安全性評價,血細胞計數發現注射人工病毒對血細胞數量無明顯影響,基因測序顯示正常組織中的突變率均低於0.4%,且都不是插入或者缺失突變,僅為單鹼基替換突變,顯示出人工病毒+CRISPR的良好應用前景。
參考文獻:Artificial Virus Delivers CRISPR-Cas9 System for Genome Editing of Cells in Mice
CRISPR首次對非分裂細胞進行基因編輯
第三個研究是美國加州大名鼎鼎的SALK研究所首次在基因組的靶位點上將DNA插入到非分裂細胞。基於CRISPR/Cas9技術,作者發明了一種同源非依賴性靶向插入技術(HITI),不但可以在體外條件下,顯著提高外源基因插入分裂細胞和非分裂細胞的效率,更為重要的是,在體內條件下也可以達到相同的效果,利用HITI技術還可以提高大鼠色素性視網膜炎模型中的視覺功能。
HITI技術即同源非依賴性靶向插入。通過優化非同源性末端接合(NHEJ)的DNA修復通路,將其與CRISPR技術相結合,創建了一個由混合核酸組成的定製插入包。首先,在體外條件下,利用常規工具細胞株HEK293,檢測HITI方法介導的基因編輯。觀察HITI技術在遺傳性疾病模型中的糾正能力,這裡採用大鼠色素性視網膜炎模型。
進一步將HITI技術整合到目前基因治療中相對安全的病毒中,即腺相關病毒AAV,檢測全身給予AAV介導的HITI是否具有治療效果。
這是首次表明HITI可能在非分裂細胞中發揮作用。其美妙之處在於它可適應於任何靶向基因組編輯系統,而不僅僅是CRISPR/Cas9。因此,隨著這些系統的安全性和有效性得到改善,HITI的有效性也將會得到改善。
參考文獻:In vivo genome editing via CRISPR/Cas9 mediated homology-independent targeted integration
可以看到,目前CRISPR還是最火的基因編輯工具。在中國,CRISPR沒有很多羈絆而飛速發展,已經處於領先水平。該技術與之前的基因編輯技術相比,效率高,適應面廣,而且操作簡單,周期相對較短。這讓基因編輯技術的廣泛應用和普及成為可能。近年來,相當多的文章報道了應用CRISPR/Cas9方法在不同物種中實現了基因敲除、插入和突變的案例。
因此,解螺旋開展基因編輯CRISPR-Cas9培訓班,講師們對CRISPR-Cas9基因編輯技術在非編碼RNA、腫瘤、基因治療等研究領域的應用有深入的理解。他們會為您詳細介紹CRISPR-Cas9技術操作,讓您快速掌握技術難點;並總結基因編輯與CRISPR-Cas9文章發表的思路,讓您學會此類文章的設計寫作套路。
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