應用網路藥理學技術研究中藥復方/單體作用機制

第2/3期應用網路藥理學和生物信息學技術研究中藥復方/單體作用機制學習班

——中藥復方SCI如何突破5分大關？

瑋瑜主辦

 

2017

年

8

月

19

日

-20

日

上海

 

 

2017

年

8

月

26

日

-27

日

北京

最新說明：

2017

年

7

月我公司首次在上海舉辦本次學習班，深受學員的好評。應廣大學員的邀請和方便大家暑期學習，我們特在上海和北京分別舉辦第二、第三期網路藥理學學習班。請大家積極報名參加。

首期學員評價：

 

課程簡介

中藥復方以及中藥單體配伍製劑是現代中醫治療疾病的主要方式，它通過潛在的成分-靶點相互作用來治療各種疾病，在降低不良反應的同時最大化治療效果。然而，由於中藥的成份多、作用機制複雜的特點造成了中藥作用機理的不明確，研究難度大，尤其是在SCI論文發表過程中無法獲得認可和支撐。

近年來，隨著網路藥理學和生物信息學的發展，將生物信息學技術和網路藥理學方法相糅合，聯合實驗驗證成為中藥復方機制研究中的重要方式之一，在SCI論文發表方面獲得了新的進展。基於該模式的中藥復方研究打破了傳統的中藥復方機制研究的瓶頸，使得原先難以定性的機製得以預測和驗證。該研究方法適用於各類病症的中藥復方/單體治療機制研究，現已成功應用於多篇SCI（IF＞5）論文的發表。

與此同時，中藥單體和復方的研究成為近年來研究的熱點和國自然基金重點扶持的領域，作為臨床醫生、科研人員和碩博士研究生，尤其是沒有生物信息學分析基礎和網路藥理學基礎的初學者，在面對錯綜複雜的數據時，難免會無從下手，遇到一個小小的技術難點總會卡住很久，研究進度十分緩慢。比如下面這些問題：

（1）如何去篩選中藥復方的有效成分和預測作用靶點？具體如何操作，如何實現，有無高效可行的方案？

（2）如何去挖掘成分-靶點、靶點-疾病、靶點-信號通路之間的關係？並繪製網路關係圖？

（3）如何通過多種方式去預測中藥單體成分作用的靶點，並進行機制研究？

（4）如何利用生物信息學資料庫將基因表達數據和藥物機制關聯在一起？

（5）如何利用生物信息學的方式解析中藥復方/單體的作用機制，把疾病-藥物-機制三者關聯在一起？

（6）如何利用GEO等資料庫，在沒有R語言基礎的情況下也能實現晶元分析和處理，挖掘免費可得的數據，為自己的中藥復方研究和基金申請增添亮點？

（7）如何利用多種富集分析的技術和方法，為自己的機制研究提供方向指引，為文章發表和基金申請繪製高質量的富集分析圖片？

（8）如何利用網路藥理學和生物信息學的方式，通過大數據挖掘和整合分析，為自己的國自然基金添磚加瓦，充實自身的前期研究基礎，講好屬於你的故事？

本次學習班將帶領廣大學員，共同學習將網路藥理學和生物信息學相結合的中藥復方研究思路，突破中藥復方SCI文章的5分魔咒。現場實戰教學，帶領學員解析中藥復方作用機制，學員也可以將自己研究的復方帶來學習班，利用課間時間解析中藥復方作用機制。

 

課程內容、目標與特色

本次學習班課程嚴格按照中藥復方解析的順序設計，層層遞進，逐步挖掘中藥復方的作用機制。將講述如何利用

VBA

工具檢索復方成分並使用

ADME

參數篩選有效成分；如何利用

VBA

工具檢索成分靶點；同時也會講述如何使用藥效團模型靶點預測工具開展中藥單體成分的機制研究；如何使用

Cytoscape

構建成分

-

靶點網路和進行網路拓撲分析，以及多種插件的靈活使用；

如何利用

Cytoscape

構建多資料庫來源的蛋白質相互作用網路；如何利用拓撲分析演算法篩選網路核心靶點；

講述如何將

GEO

資料庫和

Connectivity Map

資料庫相關聯，應用於中藥復方的機制研究；如何利用簡單在線工具進行富集分析，以及繪製富集散點圖、文恩圖等。

本次學習班全程電腦實戰教學，

90%

以上為上機指導操作，無繁瑣的理論授課，有超過

30

種資料庫和在線分析工具的使用教學，做到課程學完，就能獨立解析中藥復方，分析復方

/

中藥單體治療疾病的潛在分子機制，為後續的實驗驗證研究提供指導。

 

授課老師

本次主講老師成功將網路藥理學和生物信息學技術相結合，應用於中藥復方的機制研究，發表和參與發表多篇

5

分以上的中藥復方機制研究的文章。

適合對象：

各級醫院臨床醫生、藥師、科研單位研究人員、高校老師、碩

/

博士研究生、對網路藥理學和生物信息學感興趣的廣大師生。同樣適合準備申請國自然、省自然基金，希望能夠使用網路藥理學和生物信息學的分析手段充實基金前期研究基礎，提升基金邏輯性和故事性的老師。（

尤其適合初學者和無基礎的學員，無需學習任何

R

語言，輕鬆解析中藥復方

/

單體的作用機制，講好故事，寫好基金，做好課題，發好文章

）

 

課程設置

第一天上午：中藥復方有效成分的篩選、靶點預測和分析

1.

      

中藥復方網路藥理學和生物信息學結合的

SCI

文章套路學習

2.

      

中藥有效成分的查找和基於

ADME

參數的成分篩選（包括使用

VBA

工具快速獲取中藥成分信息數據，上機實戰）

3.

      

應用多種方式預測中藥有效成分或單體成分的靶點、靶點整理和基因名轉換（包括使用

VBA

工具快速獲取成分

-

靶點關係數據，上機實戰）

4.

      

基於藥效團模型的中藥單成分

/

化合物的靶點預測（包括

PubChem

資料庫的簡單使用和成分

3D

結構文件的下載，上機實戰）

 

第一天下午：疾病相關靶點的檢索和生物信息學技術在中藥復方中的應用

1.

      

基於網路藥理學的分子對接靶點驗證（快速分子對接，單個成分多個靶點對接或者多個成分多個靶點對接，簡單易學，適合初學者，發文章夠用，上機實戰）

2.

      

疾病相關靶點的檢索和獲取（通過多個資料庫聯合檢索疾病相關的已知靶點，實戰演示）

3.

      

GEO

資料庫分析和獲取特定疾病靶點（包括

GEO

資料庫的簡單介紹，

GEO

晶元的在線分析和利用在線工具進行

GEO

晶元的分析，繪製熱圖，非常適合沒有

R

語言基礎的初學者，上機實戰）

4.

      

利用文本挖掘工具檢索疾病相關靶點，增加疾病靶點可靠性。

5.

      

基於

ConnectivityMap

的中藥復方或單成分的機制研究，以及藥物耐葯、藥物預警研究思路探討。

 

第二天上午：成分靶點網路構建和

Cytoscape

詳細使用

1.

      

多種方式繪製文恩圖，交集分析。包括在線工具、軟體等方式，最多支持

6

組的文恩圖分析，無需任何

R

語言基礎，上機實戰。

2.

      

成分

-

靶點網路構建過程中數據文件的編排以及網路繪圖的注意事項，上機實戰

3.

      

Cytoscape

軟體以及相關插件的詳細使用（包括中藥復方成分

-

靶點網路繪製、網路美化和調整、交集網路構建、子網路提取構建、圖片導出和數據導出等，上機實戰）

 

第二天下午：中藥復方作用機制分析和其他分析手段拓展

1.

      

常用蛋白質相互作用關係資料庫的介紹以及使用

Cytoscape

插件快速構建蛋白質相互作用關係網路，並使用拓撲分析，尋找蛋白質相互作用網路中的關鍵節點，構建子網路，上機實戰。

2.

      

基於

DAVID

的靶點

GO

注釋分析和

KEGG

信號通路分析，以及利用在線工具繪製富集散點圖，利用

Bingo

、

GlueGO

等

Cytoscape

插件進行富集分析和結果繪圖，上機實戰。

3.

      

常用網址的使用和簡單教學（包括簡單的

miRNA

靶基因預測、文本演算法挖掘工具簡單教學等，根據時間安排，上機實戰）

 

備註：

自帶筆記本電腦，安裝

WINDOWS

操作系統，需要安裝

Cytoscape3.2.1

（需要安裝

java

，具體插件報名後告知如何安裝）、

OfficeExcel 2013

等軟體。

 

主辦單位

上海瑋瑜生物科技有限公司

會議時間地點

（沒有強行規定，可以自訂酒店，住宿費用自理）

上海：

2017

年

8

月

19

日

-20

日

  18

日報到

  

上海寶豐聯大酒店

（上海市虹口區紀念路

301

號）

住宿： 上海寶豐聯大酒店

，標準間（含早）380元/人、合住190元/人，費用自理。合住的學員最後出現單人無法安排的情況，需要自補房間差價。

北京：

2017

年8月26-27日  25日報到  北京景都桂龍大酒店（北京市丰台區廣安路蓮花池南里21號）

住宿：

北京景都桂龍大酒店，標準間（含早）380元/人、合住190元/人，費用自理。合住的學員最後出現單人無法安排的情況，需要自補房間差價。

 

註冊費用：

2600

元

/

人。

授課期間

發放紙質邀請函（蓋章）和發票。

按交費先後順序確定座位號。會務期間提供午餐，晚餐自理。

付款方式：

1

，轉賬或支付寶：您可以按照下面的指定賬號放心匯款，匯款前您也可以和招生老師核對賬戶

2

，現場刷卡或現金：您也可以現場刷卡和支付現金。

A

：匯款賬戶

賬戶名稱：上海服淡信息科技有限公司     賬戶號：31578103002581719

開戶行：上海銀行桃浦支行

B

：支付寶轉賬

 

收款人：wybiot@163.com     戶  名:上海瑋瑜生物科技有限公司

匯款時寫上您的姓名，如果朋友代付一定要註明您本人的名字，便於好查詢。

疑問諮詢：

聯繫人：謝老師

13611825136    

報名郵箱：

wybiot@126.com

報名方式：掃描二維碼或點擊閱讀原文

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