Cell子刊:免疫疾病背後的表觀遺傳學
生物通報道:近幾十年,過敏、糖尿病和其他免疫疾病顯著增多。在這一趨勢中,環境起到的作用可能比基因更大。因此,Link?ping大學的研究團隊開始在常見免疫疾病中尋找潛在的非遺傳學因素。表觀遺傳學修飾吸引了他們的注意。
表觀遺傳學修飾可以在不改變DNA序列的情況下調控基因的活性,而且這種修飾會受到環境因素的影響。5-甲基胞嘧啶(5mC)是哺乳動物基因組最常見的一種表觀遺傳學修飾,廣泛參與了細胞對基因表達的控制,在細胞生長、細胞分化、細胞增殖和疾病狀態中起到了關鍵性作用。
TET家族的雙加氧酶能夠將5mC逐步氧化成5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)、5-甲醯基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)。研究人員發現,人類CD4+ T細胞的分化過程中存在廣泛的5hmC重塑。在患者樣本中也很容易檢測到5hmC的存在。研究顯示,與常見免疫疾病有關的許多DNA區域富含5hmC。
這項發表在Cell Reports雜誌上的研究指出,5hmC介導的DNA去甲基化對人類CD4+ T細胞很關鍵,在基因表達和細胞分化中起到了重要的作用。5hmC將基因與環境關聯起來,二者共同起作用引發人類疾病。研究人員認為,5hmC在疾病診斷和個性化醫療中有著廣闊的應用前景。
在哺乳動物的早期胚胎髮育階段,基因組DNA會發生大規模的主動去甲基化。但去甲基化的分子機制一直是表觀遺傳領域的一大謎題。芝加哥大學的何川(Chuan He)教授領導研究團隊,為人們揭示了全基因組範圍上的DNA去甲基化動態。這項研究發表在Cell Research雜誌上。(更多詳細信息參見:何川教授Cell Res發表表觀遺傳學新成果)
5mC由DNA甲基轉移酶催化產生,廣泛參與了細胞對基因表達的調控。不過,活性啟動子和增強子上基本沒有這種表觀遺傳學修飾。何川教授與加州大學的任兵(Bing Ren)教授合作,揭示了甲基化和去甲基化對增強子活性的調節。研究顯示,這一機制決定了細胞分化過程中的轉錄組重編程。相關論文發表在Molecular Cell雜誌上。(更多詳細信息參見:何川、任兵、徐國良Cell子刊發表表觀遺傳學新成果)
去年二月,NEB(NewEngland Biolabs, Inc.)公司的研究團隊開發了一種低成本的酶學分析方法,能夠獲得單鹼基解析度的5hmC和5fC全基因組圖譜。這項研究發表在近日的Molecular Cell雜誌上,文章的通訊作者是NEB的Shengxi Guan 和Zhenyu Zhu。(更多詳細信息參見:無需重亞硫酸鹽轉化的5hmC精確定位法)
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