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單細胞基因組測序:從實驗到分析,步步解析

單細胞基因組測序:從實驗到分析,步步解析



隨著生命科學研究的微觀化,基於細胞群體的研究方法已不適用於某些研究領域(如腫瘤異質性、早期胚胎髮育等)。單細胞基因組測序通過在單個細胞水平上進行測序,解決了用組織樣本無法獲得不同細胞間的異質性信息或樣本量太少無法進行常規測序的難題,為科學家研究單個細胞的行為、機制等提供了新的方向。

【應用概覽】


從2011年Navin等人將全基因組擴增技術與高通量測序技術結合起來進行乳腺癌細胞研究開始,單細胞基因組測序技術已逐漸被應用於神經科學、生殖系演化、器官發生、腫瘤、臨床診斷、免疫學、微生物學、組織嵌合、胚胎髮育以及產前遺傳學診斷等研究領域,並被《自然方法》雜誌( Nature Methods )列入2013年度值得期待的技術之一。

單細胞基因組測序:從實驗到分析,步步解析


單細胞測序發展歷程及出版物數量和類目[1]

單細胞基因組測序:從實驗到分析,步步解析



單細胞基因組測序技術被廣泛應用於生物科學和生物醫學領域[1]


【技術流程】

單細胞基因組測序主要包括四個步驟:單細胞分離→全基因組擴增→高通量測序→數據分析。其中,單細胞分離及全基因組擴增對最終結果的準確性起到了關鍵作用。

單細胞基因組測序:從實驗到分析,步步解析



單細胞測序流程示意圖[2]


1. 單細胞分離

將單個細胞從組織中分離出來是單細胞基因組測序的第一步。雖然已有較成熟的用於分離在細胞群體中占多數的單細胞的技術,但分離在細胞群體中罕見(


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