《Nature》子刊:GWAS一次性斬獲12個高癌風險位點
5個有關睾丸癌的主要課題組共同提供的一組數據分析指出了易受遺傳性睾丸生殖細胞腫瘤影響的新遺傳位點。研究人員稱它為基因組圖譜的又一成功故事。這項發現將幫助醫生了解哪些人的患病風險最高,指導醫生重點篩查這些人群。
國際睾丸研究協會(The international Testicular Cancer Consortium,TECAC)的研究人員在賓夕法尼亞大學Perelman醫學院轉化醫學和人類遺傳學教授Katherine L. Nathanson醫學博士的領導下,與多個機構展開合作,最終獲得了今日發表在《Nature Genetics》上的研究成果。該論文的第一作者是Zhaoming Wang,他在美國國立癌症研究所Stephen J. Chanock醫學博士的指導下工作。
睾丸生殖細胞腫瘤(testicular germ cell tumor,TGCT)占睾丸癌病例的95%。在美國和歐洲國家,TGCT是20歲到39歲男性最常見的癌症,在過去的20年間病例數逐年上漲。儘管有明顯證據表明,該腫瘤的易感性來自遺傳,但是人們還沒有找到一個類似乳腺癌BRCA1突變的外顯率高的睾丸癌致病基因。
在此背景之下,用於鑒定疾病風險相關常見變異的全基因組關聯研究(genome-wide association studies,GWAS)在這項最新的突出研究之中大放光彩。
Nathanson和她的研究團隊使用GWAS分析術,發現了染色體上與TGCT風險增加有關的變異loci。他們結合了來自5個國際TGCT研究、將近3600個癌症病例的GWAS數據。
「我們發現了來自前所未知的染色體區域內的8個loci,」Nathanson說。「我們還發現了來自已知區域內的4個新loci。」
Nathanson指出,新位點的識別不僅僅具有統計層面意義,它們還具有生物學層面意義,暗示出特定途徑的破壞,特別是涉及雄性生殖細胞發育、成熟和功能的途徑。
「相比其他類型癌症,我們計算髮現,TGCT的位點特異性遺傳佔比很高,但是loci位點數目較少。」
加上此次新鑒定的12個loci,目前已知的loci數目總數累計40個。Nathanson說,綜合所有loci,大約37%的父親傳遞給兒子的睾丸癌家族性風險將有據可循。
「儘管這種癌症可被治癒,但是此項新發現表明,關於這類特殊的疾病類型,我們仍需再接再厲,」Nathanson受。「基因組學發現可指導我們確定哪些病人處於高發病風險,哪些病人需要篩查,尤其對隱睾人群,精確的早期篩查更加有用。」
原文標題
Meta-analysis of five genome-wide association studies identifies multiple new loci associated with testicular germ cell tumor
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