MJ：對決定間日瘧原蟲多樣性的因素進行鑒定

導語：CMB區域間日瘧原蟲的遺傳多樣性較高，入侵和耐葯基因陽性選擇信號較為符合CMB區域瘧疾消除項目中藥物使用史。

來源：梅斯醫學

近日，國際雜誌 《MJ》在線發表一項關於全基因組掃描鑒定陽性選擇下的間日瘧原蟲基因的研究。

目前從東南亞輸入到中國的間日瘧原蟲病例趨勢近年來急劇增加，特別是中緬邊界地區。與變化的傳播強度相關的間日瘧原蟲種群的高重組率可能會導致不同的局部選擇壓力。然而目前關於該地區間日瘧原蟲遺傳變異性的信息很少。因此，本研究評估了CMB區域間日瘧原蟲基因組序列的遺傳多樣性，旨在提供新基因座位上的陽性選擇的信息。

本項研究通過對CMB區域中的間日瘧原蟲的全基因組調查，採用來自當地患者的血液樣本來確定人群特異性選擇性過程。結果表明，在一些重要的基因家族中，所測序的間日瘧原體分離株之間有相當大的遺傳多樣性和平均配對差異。使用標準化綜合單倍型分數（| iHS |）對SNP高於1％分布的染色體區域中的所有SNP進行分析，觀察到最高得分位點共涉及356個基因，其中大部分與紅細胞侵襲和免疫逃避相關。此外，還應用XP-EHH進行檢測，並在高陽性評分列表中觀察到與抗瘧疾耐藥性相關的一些重要基因。這一結果表明，CMB區的間日瘧原蟲面臨比任何其它區域更大的生存壓力，並導致與宿主-瘧原蟲相互作用相關的基因的強陽性選擇。

本研究表明，CMB區域間日瘧原蟲的遺傳多樣性較高，入侵和耐葯基因陽性選擇信號較為符合CMB區域瘧疾消除項目中藥物使用史。此外，該結果還表明基於單倍型的檢測選擇可以協助全基因組方法對決定間日瘧原蟲多樣性的因素進行鑒定。

原始出處：

Hai-Mo ShenShen-Bo Chen, et al.Genome-wide scans for the identification of Plasmodium vivax genes under positive selection.

本文系梅斯醫學（MedSci）原創編譯整理，轉載需授權！

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